Changes between Version 33 and Version 34 of RxNormForVista


Ignore:
Timestamp:
Nov 21, 2013, 5:13:36 PM (10 years ago)
Author:
Sam Habiel
Comment:

--

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified

  • RxNormForVista

    v33 v34  
    374374
    375375== Technical Details ==
    376 * Package File Entry Name is C0CR
     376The following are technical details.
     377
     378=== Package File Entry ===
     379
     380=== Dependencies ===
     381 * Kernel 8
     382 * Fileman 22
     383
     384=== Routine list ===
     385
     386=== Description of routines and overall flow ===
     387
     388=== Modifications to National VA distributed routines ===
     389None.
     390
     391### File list
     392None included.
     393
     394### Exported Options
     395None included.
     396
     397### Archiving and Purging
     398Not supported.
     399
     400### Supported APIs
     401
     402### External Interfaces, External Relations
     403None
     404
     405### Internal relations
     406None.
     407
     408### Package wide-variables
     409None.
     410
     411### Security
     412This software implements no security of its own. It inherits pharmacy security.
     413
     414### File Structure
     415All files have only a zero node for each entry and correspond as much as possible to the RxNorm file format, except that the '|' has been substitued with a "^". The exception to that rule is when a file's first field cannot be the .01 because it's missing for some entries. In this case, the first field and a key field are switch so that the key field can be the .01.
     416
     417{{{
     418CONDENSED DATA DICTIONARY---RXNORM CONCEPT NAMES AND SOURCES FILE (#176.001)UCI: F201303,ICARUS
     419
     420STORED IN: ^C0CRXN(176.001,                               11/21/13    PAGE 1
     421------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     422
     423                                                  FILE SECURITY
     424                                   DD SECURITY    : @     DELETE SECURITY:
     425                                   READ SECURITY  :       LAYGO SECURITY :
     426                                   WRITE SECURITY : @
     427CROSS REFERENCED BY:
     428     
     429
     430FILE #176.001
     431INDEXED BY:       RXCUI (B), CODE (CODE), SAB & TTY & CODE & RXCUI (STC), STR (STR), SAB & TTY & RXCUI & CODE (STX)
     432
     433
     434                                 FILE STRUCTURE
     435
     436FIELD     FIELD
     437NUMBER    NAME
     438
     439.01       RXCUI (RFJ8), [0;1]
     440.02       LAT (RFJ3), [0;2]
     441.03       TS (FJ1), [0;3]
     442.04       LUI (FJ8), [0;4]
     443.05       STT (FJ3), [0;5]
     444.06       SUI (FJ8), [0;6]
     445.07       ISPREF (FJ1), [0;7]
     446.08       RXAUI (RFJ8), [0;8]
     447.09       SAUI (FJ50), [0;9]
     448.1        SCUI (FJ50), [0;10]
     449.11       SDUI (FJ50), [0;11]
     450.12       SAB (RFJ20), [0;12]
     451.13       TTY (RFJ20), [0;13]
     452.14       CODE (RFJ50), [0;14]
     453.15       STR (RFJ3000), [0;15]
     454.16       SRL (FJ10), [0;16]
     455.17       SUPPRESS (FJ1), [0;17]
     456.18       CVF (FJ50), [0;18]
     45750        COMPUTED DRUGS (Cmp50), [ ; ]
     458
     459
     460
     461CONDENSED DATA DICTIONARY---RXNORM SIMPLE CONCEPT AND ATOM ATTRIBUTES FILE (#176.002)UCI: F201303,ICARUS
     462
     463STORED IN: ^C0CRXN(176.002,                               11/21/13    PAGE 1
     464------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     465
     466                                                  FILE SECURITY
     467                                   DD SECURITY    : @     DELETE SECURITY: @
     468                                   READ SECURITY  :       LAYGO SECURITY : @
     469                                   WRITE SECURITY : @
     470CROSS REFERENCED BY:
     471      ATN(XATN)  ATV(XATV)
     472
     473FILE #176.002
     474INDEXED BY:       RXCUI & SAB & ATN & ATV (ANDFRT), SAB & ATN & ATV & RXCUI (ASAA), SAB & ATN & RXCUI & ATV (ASAR), RXCUI (RXCUI)
     475
     476
     477                                 FILE STRUCTURE
     478
     479FIELD     FIELD
     480NUMBER    NAME
     481
     482.01       ATN (RFJ1000), [0;1]
     483.02       LUI (FJ8), [0;2]
     484.03       SUI (FJ8), [0;3]
     485.04       RXAUI (FJ8), [0;4]
     486.05       STYPE (FJ50), [0;5]
     487.06       CODE (FJ50), [0;6]
     488.07       ATUI (FJ11), [0;7]
     489.08       SATUI (FJ50), [0;8]
     490.09       RXCUI (FJ8), [0;9]
     491.1        SAB (RFJ20), [0;10]
     492.11       ATV (FJ4000), [0;11]
     493.12       SUPPRESS (FJ1), [0;12]
     494.13       CVF (FJ50), [0;13]
     495
     496
     497
     498CONDENSED DATA DICTIONARY---RXNORM SOURCE INFORMATION FILE (#176.003)UCI: F201303,ICARUS
     499
     500STORED IN: ^C0CRXN(176.003,                               11/21/13    PAGE 1
     501------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     502
     503                                                  FILE SECURITY
     504                                   DD SECURITY    : @     DELETE SECURITY: @
     505                                   READ SECURITY  :       LAYGO SECURITY : @
     506                                   WRITE SECURITY : @
     507CROSS REFERENCED BY:
     508      RSAB(B)
     509
     510
     511                                 FILE STRUCTURE
     512
     513FIELD     FIELD
     514NUMBER    NAME
     515
     516.01       RSAB (RFJ20), [0;1]
     517.02       RCUI (FJ8), [0;2]
     518.03       VSAB (FJ40), [0;3]
     519.04       VCUI (FJ8), [0;4]
     520.05       SON (FJ3000), [0;5]
     521.06       SF (FJ20), [0;6]
     522.07       SVER (FJ20), [0;7]
     523.08       VSTART (FJ10), [0;8]
     524.09       VEND (FJ10), [0;9]
     525.1        IMETA (FJ10), [0;10]
     526.11       RMETA (FJ10), [0;11]
     527.12       SLC (FJ1000), [0;12]
     528.13       SCC (FJ1000), [0;13]
     529.14       SRL (NJ10,0), [0;14]
     530.15       TFR (NJ10,0), [0;15]
     531.16       CFR (NJ10,0), [0;16]
     532.17       CXTY (FJ50), [0;17]
     533.18       TTYL (FJ300), [0;18]
     534.19       ATNL (FJ1000), [0;19]
     535.2        LAT (FJ3), [0;20]
     536.21       CENC (FJ20), [0;21]
     537.22       CURVER (FJ1), [0;22]
     538.23       SABIN (FJ1), [0;23]
     539.24       SSN (FJ3000), [0;24]
     540.25       SCIT (FJ4000), [0;25]
     541
     542
     543
     544CONDENSED DATA DICTIONARY---RXNORM SEMANTIC TYPES FILE (#176.004)UCI: F201303,ICARUS
     545
     546STORED IN: ^C0CRXN(176.004,                               11/21/13    PAGE 1
     547------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     548
     549                                                  FILE SECURITY
     550                                   DD SECURITY    : @     DELETE SECURITY: @
     551                                   READ SECURITY  :       LAYGO SECURITY : @
     552                                   WRITE SECURITY : @
     553CROSS REFERENCED BY:
     554      RXNCUI(B)
     555
     556
     557                                 FILE STRUCTURE
     558
     559FIELD     FIELD
     560NUMBER    NAME
     561
     562.01       RXNCUI (RFJ8), [0;1]
     563.02       TUI (FJ4), [0;2]
     564.03       STN (FJ100), [0;3]
     565.04       STY (FJ50), [0;4]
     566.05       ATUI (FJ11), [0;5]
     567.06       CVF (FJ50), [0;6]
     568
     569
     570
     571CONDENSED DATA DICTIONARY---RXNORM RELATED CONCEPTS FILE (#176.005)UCI: F201303,ICARUS
     572
     573STORED IN: ^C0CRXN(176.005,                               11/21/13    PAGE 1
     574------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     575
     576                                                  FILE SECURITY
     577                                   DD SECURITY    : @     DELETE SECURITY: @
     578                                   READ SECURITY  :       LAYGO SECURITY : @
     579                                   WRITE SECURITY : @
     580CROSS REFERENCED BY:
     581     
     582
     583FILE #176.005
     584INDEXED BY:       RXCUI1 & RELA & RXCUI2 (B)
     585
     586
     587                                 FILE STRUCTURE
     588
     589FIELD     FIELD
     590NUMBER    NAME
     591
     592.01       SAB (RFJ20), [0;1]
     593.02       RXAUI1 (FJ8), [0;2]
     594.03       STYPE1 (FJ50), [0;3]
     595.04       REL (FJ4), [0;4]
     596.05       RXCUI2 (FJ8), [0;5]
     597.06       RXAUI2 (FJ8), [0;6]
     598.07       STYPE2 (FJ50), [0;7]
     599.08       RELA (FJ100), [0;8]
     600.09       RUI (FJ10), [0;9]
     601.1        SRUI (FJ50), [0;10]
     602.11       RXCUI1 (FJ8), [0;11]
     603.12       SL (FJ1000), [0;12]
     604.13       DIR (FJ1), [0;13]
     605.14       RG (FJ10), [0;14]
     606.15       SUPPRESS (FJ1), [0;15]
     607.16       CVF (FJ50), [0;16]
     608
     609
     610
     611CONDENSED DATA DICTIONARY---RXNORM DOCUMENTATION FOR ABBREVIATED VALUES FILE (#176.006)UCI: F201303,ICARUS
     612
     613STORED IN: ^C0CRXN(176.006,                               11/21/13    PAGE 1
     614------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     615
     616                                                  FILE SECURITY
     617                                   DD SECURITY    : @     DELETE SECURITY: @
     618                                   READ SECURITY  :       LAYGO SECURITY : @
     619                                   WRITE SECURITY : @
     620CROSS REFERENCED BY:
     621      DOCKEY(B)
     622
     623
     624                                 FILE STRUCTURE
     625
     626FIELD     FIELD
     627NUMBER    NAME
     628
     629.01       DOCKEY (RFJ50), [0;1]
     630.02       VALUE (FJ1000), [0;2]
     631.03       TYPE (FJ50), [0;3]
     632.04       EXPL (FJ1000), [0;4]
     633
     634}}}
     635
     636A crucial part of speed in the RxNorm operations is the extensive indexing on the files. What follows are the defined new-style
     637indexes:
     638
     639{{{
     640NEW-STYLE INDEX LIST -- FILE #176.001                                                                           11/21/13    PAGE 1
     641-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     642
     643File #176.001
     644
     645  New-Style Indexes:
     646
     647  B (#983)    FIELD    REGULAR    IR    LOOKUP & SORTING
     648      Short Descr:  Regular B Index
     649        Set Logic:  S ^C0CRXN(176.001,"B",X,DA)=""
     650       Kill Logic:  K ^C0CRXN(176.001,"B",X,DA)
     651       Whole Kill:  K ^C0CRXN(176.001,"B")
     652             X(1):  RXCUI  (176.001,.01)  (Subscr 1)  (forwards)
     653
     654  CODE (#1020)    FIELD    REGULAR    IR    LOOKUP & SORTING
     655      Short Descr:  Code Index
     656        Set Logic:  S ^C0CRXN(176.001,"CODE",X,DA)=""
     657       Kill Logic:  K ^C0CRXN(176.001,"CODE",X,DA)
     658       Whole Kill:  K ^C0CRXN(176.001,"CODE")
     659             X(1):  CODE  (176.001,.14)  (Subscr 1)  (forwards)
     660
     661  STC (#1021)    RECORD    MUMPS    IR    LOOKUP & SORTING
     662      Short Descr:  Source Term Type Code Index
     663      Description:  Use this index to do compound searches on RxNorm Concepts. 
     664                     
     665                    Examples: SAB="NDDF", TTY="CDC", CODE={GCN} will give you the entry a clinical drug in First Database with GCN
     666                    Code {GCN}. 
     667                     
     668                    SAB="RXNORM", TTY="SCD", CODE={RXNORM} will give you the entry that is the Semantic Clinical Drug for the
     669                    RxNorm code. 
     670                     
     671                    SAB="VANDF", TTY="CD", CODE={VUID} will give you a drug that has that VUID. 
     672        Set Logic:  S ^C0CRXN(176.001,"STC",X(1),X(2),X(3),DA)=X(4)
     673       Kill Logic:  K ^C0CRXN(176.001,"STC",X(1),X(2),X(3),DA)
     674       Whole Kill:  K ^C0CRXN(176.001,"STC")
     675             X(1):  SAB  (176.001,.12)  (Subscr 1)  (forwards)
     676             X(2):  TTY  (176.001,.13)  (Subscr 2)  (forwards)
     677             X(3):  CODE  (176.001,.14)  (Subscr 3)  (forwards)
     678             X(4):  RXCUI  (176.001,.01)  (forwards)
     679
     680  STR (#1022)    FIELD    REGULAR    IR    LOOKUP & SORTING
     681      Short Descr:  String Lookup Index
     682        Set Logic:  S ^C0CRXN(176.001,"STR",$E(X,1,30),DA)=""
     683       Kill Logic:  K ^C0CRXN(176.001,"STR",$E(X,1,30),DA)
     684       Whole Kill:  K ^C0CRXN(176.001,"STR")
     685             X(1):  STR  (176.001,.15)  (Subscr 1)  (Len 30)  (forwards)
     686                      Transform (Storage):  S X=$$UP^XLFSTR(X)
     687                       Transform (Lookup):  S X=$$UP^XLFSTR(X)
     688
     689  STX (#1023)    RECORD    MUMPS    IR    LOOKUP & SORTING
     690      Short Descr:  Source Term Type RxCUI Code Index
     691      Description:  Use this index as a reverse of the STC index. 
     692                     
     693                    The STC index will give you an entry if you know the source and the type and the code. This index will give you
     694                    the codes if you know the source, the type, but not the code, but rather the RxNorm code. 
     695        Set Logic:  S ^C0CRXN(176.001,"STX",X(1),X(2),X(3),DA)=X(4)
     696       Kill Logic:  K ^C0CRXN(176.001,"STX",X(1),X(2),X(3),DA)
     697       Whole Kill:  K ^C0CRXN(176.001,"STX")
     698             X(1):  SAB  (176.001,.12)  (Subscr 1)  (forwards)
     699             X(2):  TTY  (176.001,.13)  (Subscr 2)  (forwards)
     700             X(3):  RXCUI  (176.001,.01)  (Subscr 3)  (forwards)
     701             X(4):  CODE  (176.001,.14)  (forwards)
     702
     703NEW-STYLE INDEX LIST -- FILE #176.002                                                                           11/21/13    PAGE 1
     704-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     705
     706File #176.002
     707
     708  New-Style Indexes:
     709
     710  ANDFRT (#1024)    RECORD    REGULAR    IR    SORTING ONLY
     711      Short Descr:  RxNorm NDFRT Index
     712        Set Logic:  S ^C0CRXN(176.002,"ANDFRT",X(1),$E(X(3),1,30),$E(X(4),1,30),DA)=""
     713         Set Cond:  S X=X(2)="NDFRT"
     714       Kill Logic:  K ^C0CRXN(176.002,"ANDFRT",X(1),$E(X(3),1,30),$E(X(4),1,30),DA)
     715        Kill Cond:  S X=X(2)="NDFRT"
     716       Whole Kill:  K ^C0CRXN(176.002,"ANDFRT")
     717             X(1):  RXCUI  (176.002,.09)  (Subscr 1)  (forwards)
     718             X(2):  SAB  (176.002,.1)  (forwards)
     719             X(3):  ATN  (176.002,.01)  (Subscr 2)  (Len 30)  (forwards)
     720             X(4):  ATV  (176.002,.11)  (Subscr 3)  (Len 30)  (forwards)
     721
     722  ASAA (#1025)    RECORD    MUMPS    IR    SORTING ONLY
     723      Short Descr:  SAB (Source) ATN (Attribute Name) ATV (Value) Index
     724        Set Logic:  S ^C0CRXN(176.002,"ASAA",X(1),$E(X(2),1,30),$E(X(3),1,30),DA)=X(4)
     725       Kill Logic:  K ^C0CRXN(176.002,"ASAA",X(1),$E(X(2),1,30),$E(X(3),1,30),DA)
     726       Whole Kill:  K ^C0CRXN(176.002,"ASAA")
     727             X(1):  SAB  (176.002,.1)  (Subscr 1)  (forwards)
     728             X(2):  ATN  (176.002,.01)  (Subscr 2)  (Len 30)  (forwards)
     729             X(3):  ATV  (176.002,.11)  (Subscr 3)  (Len 30)  (forwards)
     730             X(4):  RXCUI  (176.002,.09)  (forwards)
     731
     732  ASAR (#1026)    RECORD    MUMPS    IR    SORTING ONLY
     733      Short Descr:  SAB (Source) ATN (Attribute Name) RxCUI Index
     734        Set Logic:  S ^C0CRXN(176.002,"ASAR",X(1),$E(X(2),1,30),X(3),DA)=X(4)
     735       Kill Logic:  K ^C0CRXN(176.002,"ASAR",X(1),$E(X(2),1,30),X(3),DA)
     736       Whole Kill:  K ^C0CRXN(176.002,"ASAR")
     737             X(1):  SAB  (176.002,.1)  (Subscr 1)  (forwards)
     738             X(2):  ATN  (176.002,.01)  (Subscr 2)  (Len 30)  (forwards)
     739             X(3):  RXCUI  (176.002,.09)  (Subscr 3)  (forwards)
     740             X(4):  ATV  (176.002,.11)  (forwards)
     741
     742  RXCUI (#1027)    FIELD    REGULAR    IR    LOOKUP & SORTING
     743      Short Descr:  RXCUI Index
     744        Set Logic:  S ^C0CRXN(176.002,"RXCUI",X,DA)=""
     745       Kill Logic:  K ^C0CRXN(176.002,"RXCUI",X,DA)
     746       Whole Kill:  K ^C0CRXN(176.002,"RXCUI")
     747             X(1):  RXCUI  (176.002,.09)  (Subscr 1)  (forwards)
     748
     749NEW-STYLE INDEX LIST -- FILE #176.003                                                                           11/21/13    PAGE 1
     750-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     751
     752NEW-STYLE INDEX LIST -- FILE #176.004                                                                           11/21/13    PAGE 1
     753-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     754
     755NEW-STYLE INDEX LIST -- FILE #176.005                                                                           11/21/13    PAGE 1
     756-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     757
     758File #176.005
     759
     760  New-Style Indexes:
     761
     762  B (#1028)    RECORD    REGULAR    IR    LOOKUP & SORTING
     763      Short Descr:  Compound Index for RXCUI1/RELA/RXCUI2
     764        Set Logic:  S ^C0CRXN(176.005,"B",X(1),X(2),X(3),DA)=""
     765       Kill Logic:  K ^C0CRXN(176.005,"B",X(1),X(2),X(3),DA)
     766       Whole Kill:  K ^C0CRXN(176.005,"B")
     767             X(1):  RXCUI1  (176.005,.11)  (Subscr 1)  (forwards)
     768             X(2):  RELA  (176.005,.08)  (Subscr 2)  (forwards)
     769             X(3):  RXCUI2  (176.005,.05)  (Subscr 3)  (forwards)
     770
     771NEW-STYLE INDEX LIST -- FILE #176.006                                                                           11/21/13    PAGE 1
     772-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
     773}}}